Theo 2D SDS PAGE, các protein có thể được chuyển sang màng thấm polyvinylidene difluoride (PVDF) để phân tích thêm. Giáng cấp Edman có thể được thực hiện trực tiếp từ màng PVDF. Xác định trình tự đầu N của sản phẩm của 5 đến 10 amino acid là đủ điều kiện xác định protein quan tâm (POI).